Za Přemyslovských panovníků byli ustanovovaní hradští správci zástupci krále v obvodě svého hradu. V době českého stavovského státu, do Bílé hory, byli stanovováni vždy dva krajští hejtmani, jeden z panského a druhý z rytířského stavu. Krajský hejtman rytířského stavu měl ve své pravomoci veškeré vojenské záležitosti příslušného kraje.
Kromě tradic zmíněných středověkých a raně novověkých institucí nesou krajská vojenská velitelství především částečné tradice krajských doplňovacích velitelství, zemských vojenských velitelství a z válečné historie zejména pak místních a okresních vojenských velitelství z Českého květnového povstání v roce 1945, které spolu s armádami spojenců rozhodující mírou přispěly k osvobození Českých zemí z nacistické nadvlády.
16. krajské vojenské velitelství v Karlových Varech bylo vytvořeno k 1. ledna 2003 a pracovalo pod tímto názvem do 31. prosince 2004. Krajské vojenské velitelství Karlovy Vary vzniklo podle zákona č. 585/2004 Sb. („branný zákon“) k 1. lednu 2005 a vykonává kromě jiných povinností i funkci vojenského správního úřadu.
Sídla Krajského vojenského velitelství Karlovy Vary
- V letech 2004-2008, po dobu I. rekonstrukce, bylo sídlo Krajského vojenského velitelství dislokováno v bývalé Územní vojenské správě Karlovy Vary na adrese Foersterova 24, Čertův Ostrov, Karlovy Vary
- Od 7. dubna 2008 se Krajské vojenské velitelství vrátilo do původní rekonstruované budovy na adrese Počernická 2, Sachrův Dvůr, Karlovy Vary
- V letech 2020-2021 proběhla II. rekonstrukce Krajského vojenského velitelství na adrese Počernická 553/2, Sachrův Dvůr, Karlovy Vary
Přehled velitelů a ředitelů
od 1. 1. 2003 do 31. 12. 2004
plukovník Ing. Jaroslav Müller - Velitel 16. krajského vojenského velitelství Karlovy Vary
od 1. 1. 2005 do 30. 6. 2010
plukovník Ing. Jaroslav Müller - Ředitel Krajského vojenského velitelství Karlovy Vary
od 1. 7. 2010 do 31. 3. 2014
plukovník Ing. Jan Kroupa - Ředitel Krajského vojenského velitelství Karlovy Vary
od 1. 4. 2014 do 28. 2. 2021
plukovník gšt. Ing. Jaroslav Kořínek - Ředitel Krajského vojenského velitelství Karlovy Vary
od 1. 3. 2021 do 30. 4. 2021
podplukovník Ing. Jaroslav Šesták - Ředitel Krajského vojenského velitelství Karlovy Vary z pověření
od 1. 5. 2021
plukovník gšt. Ing. František Vilím - Ředitel Krajského vojenského velitelství Karlovy Vary
